En la creación de un nuevo fármaco, llega un punto en el que finalmente tienes que poner la molécula en una criatura real, una a la vez, y ver si realmente hace lo que crees que hace. Biografías múltiples la maquinaria molecular podría permitir que cien moléculas se prueben simultáneamente en un solo sistema vivo, lo que podría alterar todo el proceso.
El espacio de descubrimiento de fármacos ha avanzado mucho en los últimos años, primero con la transcripción de genes rápida y económica, luego con CRISPR y luego con la proteómica impulsada por IA. Sin embargo, no es necesario saber lo que hacen todos ellos para comprender que, al final, sin importar cuánto aceleren la investigación fundamental, las pruebas in vivo siguen siendo un cuello de botella importante.
In vivo significa “en la vida”, a diferencia de in vitro (en vidrio) o in silico (simulado), y los ratones son las criaturas habituales que obtienen el dudoso honor de probar la seguridad y eficacia de un nuevo fármaco. Y la ecuación general es: una droga, un ratón. Debido a que esta es una parte logísticamente desafiante y que consume mucho tiempo de las pruebas de fármacos, por lo general se deja hasta que solo haya un puñado de moléculas que la empresa o el laboratorio estén seguros de que funcionarán. Pero también es la primera, y a menudo la última, vez que cualquiera de estos medicamentos realmente tiene que funcionar en un cuerpo real, y el resultado es muchos lavados.
Ingrese a Manifold Bio. La puesta en marcha, armada con $ 40 millones en fondos de la serie A, tiene como objetivo hacer que las pruebas con ratones sean cien veces más eficientes y efectivas, cambiando esa ecuación y permitiendo pruebas in vivo más tempranas que verifiquen la función de una molécula antes de invertir unos pocos millones de dólares en recursos. eso.
“El mejor entorno de prueba es la realidad”, explicó el fundador y director ejecutivo de Manifold Bio, Gleb Kuznetsov. “Pero a medida que se avanza en un programa de desarrollo de fármacos, se invierte cada vez más, para realizar experimentos y trabajos cada vez más costosos. Estamos optimizando mucho antes, por lo que una vez que estamos en la puerta final de las pruebas clínicas, avanzamos con un medicamento que ya ha sido optimizado. Si puede tener más convicción de que este es el fármaco adecuado para invertir, puede abordar el riesgo clave de su inversión”.
Actualmente, en la fase de prueba con ratones, generalmente tiene una condición objetivo y un puñado de moléculas de fármaco candidatas. Se coloca uno en cada mouse y observa lo que sucede, y existe una posibilidad real de que todos reprobaran en esta etapa crucial.
La innovación de Manifold es paralelizar las pruebas in vivo con hasta cien pruebas simultáneas en un solo ratón. Para que esto suceda, ha inventado una tecnología de “código de barras de proteínas” que podría considerar como etiquetas RFID moleculares.
Ilustración de múltiples “códigos de barras” adjuntos a proteínas para ser analizadas in vivo.
“La forma en que funciona es que adjuntamos un poco más de proteína, nuestro código de barras de proteína, y eso hace que la proteína sea rastreable y podemos rastrearla donde sea que vaya en un sistema”, dijo Kuznetsov. En lugar de verificar las pruebas de laboratorio, “es más para informar el diseño. Hay mucho desarrollo impulsado por inteligencia artificial y aprendizaje automático, mucho diseño en la computadora. Nos enfocamos en un objetivo de cáncer específico, algo en la superficie de las células cancerosas que realmente indica que se trata de una célula cancerosa, y descubrimos los diseños de medicamentos que van muy específicamente a esas células cancerosas, y no van a ningún otro lugar”.
El problema aquí es que, en esta etapa, es posible que esté viendo miles de proteínas diferentes, cada una de las cuales puede variar de las demás solo en un par de aminoácidos, los componentes básicos que dan a las proteínas su forma y función.
Ahí es donde entran los códigos de barras de Manifold. Cada proteína, por similar que sea, recibe una etiqueta que es totalmente única e identificable después del hecho cuando se somete a un proceso de conversión de ADN patentado. Cantidades iguales de 100 moléculas entran en el ratón, tal vez 95 no hagan nada, 3 se adhieren al cáncer decentemente y 2 se adhieren a un ritmo mucho mayor. Son 98 moléculas que no tiene que someter a más pruebas.
Este proceso de selección elimina mucha incertidumbre de la ecuación, ya que sabe con certeza que esta proteína realmente hace lo que usted diseñó para hacer, en un sistema de mamífero vivo. Y esto es justo después del diseño y la síntesis de bajo volumen, partes relativamente baratas y tempranas del proceso.
Desde la izquierda, los cofundadores de Manifold, Gleb Kuznetsov, Shane Lofgren y Pierce Ogden.
La parte difícil fue diseñar las propias etiquetas. Si lo piensa, cada pequeño código de barras de proteína tiene que cumplir con una barra muy alta.
“Hay un componente de biología molecular, pero también hay mucho lado computacional para hacer que estas cosas sean detectables. Tampoco deben afectar el comportamiento del fármaco y deben ser estables, detectables, únicos y fabricables”, dijo Kuznetsov. Diseñar uno sería un desafío: diseñar 100 podría ser la base de un camino de desarrollo de fármacos completamente nuevo. Lo comparó con el cambio que ocurrió en la informática cuando pasamos del procesamiento en serie en las CPU al procesamiento en paralelo en las GPU.
Sin embargo, para ser claros, esto no se trata de sobrealimentar las pruebas en otras compañías: Manifold tiene como objetivo construir una compañía farmacéutica completamente integrada verticalmente basada en este enfoque de pruebas infundido con biotecnología.
Un empleado de Manifold Bio trabaja en su laboratorio húmedo.
“Vamos a ir de extremo a extremo internamente”, dijo Kuznetsov. “Los medicamentos que tenemos en casa, creamos esas moléculas desde cero, las pusimos en estas pruebas in vivo agrupadas y pronto estarán a nivel de ensayos clínicos”.
Su ronda inicial fue para construir los cimientos y mostrar los trabajos tecnológicos, lo que ahora ha hecho. La ronda de $ 40MA es para comenzar el proceso de prueba clínica estandarizado y más costoso. La compañía se centra en el cáncer por ahora, ya que no solo es una gran amenaza, sino también una buena combinación para los tipos de medicamentos que este proceso es excelente para encontrar.
La compañía está dirigida por Kuznetsov y sus cofundadores, pero el pionero de la genética George Church ayudó a idear y construir la compañía para comenzar. Actualmente es asesor.
La nueva ronda de financiación estuvo dirigida por Triatomic Capital, con la participación de los nuevos inversores Section 32, FPV Ventures, Horizons Ventures y Tencent, y los inversores existentes Playground Global, Fifty Years y FAST by GETTYLAB.
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